Development of heterogeneous chemoenzymatic catalysts based on Metal-Organic Framework for the selective and eco-friendly amination of alcohols - Thèses de Sorbonne Université
Thèse Année : 2023

Development of heterogeneous chemoenzymatic catalysts based on Metal-Organic Framework for the selective and eco-friendly amination of alcohols

Développement de catalyseurs hétérogènes chimioenzymatiques basés sur l'utilisation de polymères de coordination poreux dédiés à l'amination éco-compatible d'alcools

Yifan Zan

Résumé

The aim of this work was to develop a heterogeneous chemoenzymatic catalyst based on the use of Metal-Organic Frameworks (MOFs) as support for the eco-friendly amination of alcohols in a one-pot cascade synthesis. The cascade process is divided into two steps: an alcohol oxidation chemically catalyzed and the subsequent enantioselective amination of the resulting carbonyl intermediate catalyzed by a ω-transaminase enzyme (ω-TA). ZIF-8 was selected as MOF for its hydro- and thermo- stability, making it an ideal support for both chemical and biological catalysts. One of the key challenges was to select a chemical catalytic system for alcohol oxidation under mild aqueous conditions that is compatible with the working conditions of ω-TAs. In this context, two supported nanoparticles catalytic systems were developed for the aerobic alcohol oxidation. In the first system, Cu2+ active sites were heterogenized on ZIF-8 for benzyl alcohol oxidation in the presence of 2,2,6,6-Tetramethylpiperidine 1-oxyl (TEMPO). The leaching issue of Cu2+ during the catalytic process was overcome by reducing Cu2+ into Cu0 within ZIF-8 pores to form supported well-dispersed Cu0 nanoparticles. This catalyst exhibits high stability and selectivity, but is not active when using water as a solvent. In the second system, well-dispersed PdAu bimetallic alloy nanoparticles were formed on ZIF-8 (PdAu@ZIF-8) to catalyze base-free aerobic alcohol oxidation in water. The catalyst shows excellent activity under mild conditions, with the best performance obtained fora Pd/Au atomic ratio 9:1. Both catalysts were characterized using PXRD, N2-adsorption, TEM, HRTEM, and XPS. The second step of the cascade process involves the biocatalytic amination of the ketone. Two S-selective ω-TAs from Silicibacter pomeroyi (3HMU) and Chromobacterium violaceum were tested. The maximum yield of S-α-methylbenzylamine obtained by amination of acetophenone in the presence of 3HMU using L-alanine as the amine donor was 77%. Efforts to combine alcohol oxidation catalyzed by the ZIF-8-supported PdAu nanoparticles and enzymatic catalysis with 3HMU in a one-pot/one-step process revealed interferences between components of the two steps. Instead, a one-pot/two-step cascade process was developed, achieving an overall S-MBA yield of 49%. Attempts were finally made to immobilize 3HMU on PdAu@ZIF-8 in order to obtain the targeted fully heterogenized catalyst by first using physical adsorption, but the activity of the hence-immobilized ω-TAs was limited. Ni2+ modification of PdAu@ZIF-8 slightly improved the enzyme immobilization. Carbonyl-functionalized ZIF-8, obtained by a partial post-synthesis exchange of the 2-methylimidazolate ligands with carbonyl-imidazolate derivatives produced encouraging results, with a 4-fold improvement in activity of 3HMU immobilized on ZIF-8-90. As outlooks, this promising approach will be further investigated in forthcoming attempts to synthesize the entirely heterogeneous 3HMU@PdAu@ZIF-8 targeted in this PhD project.
L'objectif de ce travail était de développer un catalyseur chimio-enzymatique hétérogène basé sur l'utilisation de polymères de coordination poreux (ou Metal-Organic Framework: MOF) comme supports pour l'amination durable d'alcools à travers un procédé en cascade réalisé en une seule étape. Le processus en cascade est composé de deux étapes: la reaction d’oxydation de l'alcool catalysée chimiquement et l'amination énantiosélective de l'intermédiaire carbonylé resultant, catalysée par une enzyme ω-transaminase (ω-TA). Le ZIF-8 a été choisi comme support pour sa stabilité dans l’eau et à hautes températures, ce qui en fait un support idéal pour l’immobilisation de catalyseurs chimiques et biologiques. Dans ce travail, l'un des principaux défis consistait à sélectionner un système catalytique chimique dédié à la réaction d'oxydation de l'alcool dans des conditions aqueuses douces, compatibles avec les conditions de travail des enzymes ω-TAs. Dans ce contexte, deux systèmes catalytiques à base de nanoparticules supportées ont été développés. Dans le premier système, des sites actifs Cu2+ ont été hétérogénéisés dans la structure du ZIF-8 en vue de l'oxydation de l'alcool benzylique en présence de 2,2,6,6-Tétraméthylpipéridine-1-oxyle (TEMPO). Le problème de la lixiviation du Cu2+ au cours du processus catalytique a été résolu en réduisant le Cu2+ in situ dans les pores du ZIF-8 pour former des nanoparticules de Cu0 supportées et bien dispersées au sein du support. Ce catalyseur présente une stabilité et une sélectivité élevées, mais n'est pas actif lorsque l'eau est utilisée comme solvant. Dans le second système, des nanoparticules d'alliage bimétallique PdAu dispersées au sein du ZIF-8 ont été formées (PdAu@ZIF-8) pour catalyser l'oxydation aérobie de l'alcool en milieu aqueux à pH neutre. Le catalyseur présente une excellente activité dans des conditions douces, la meilleure performance étant obtenue pour un rapport atomique Pd/Au de 9:1. Les deux catalyseurs ont été caractérisés par PXRD, physisorption d’azote, microscopie électronique à haute résolution et XPS. La deuxième étape du processus en cascade implique l'amination biocatalysée du composé carbonylé obtenu lors de la première étape. Deux ω-TA S-sélectives issues des bactéries Silicibacter pomeroyi (3HMU) et Chromobacterium violaceum ont été testées. Le rendement maximal en S-α-méthylbenzylamine obtenu par amination de l'acétophénone en présence de 3HMU en utilisant la L-alanine comme donneur d'amine était de 77%. Les efforts visant à combiner ensuite l'oxydation de l'alcool catalysée par les nanoparticules de PdAu supportées sur le ZIF-8 et la catalyse enzymatique utilisant la 3HMU dans un processus en une seule étape ont révélé des interférences entre les composants chimiques indispensables à la réalisation de chaque étape. En conséquence, un processus en cascade alternatif réalisé dans un même milieu réactionnel mais dans lequel les deux étapes sont découplées a été mis au point. Celui-ci a permis d'obtenir un rendement global de S-MBA de 49%. Des tentatives ont finalement été effectuées pour immobiliser la 3HMU sur le catalyseur PdAu@ZIF-8 afin d'obtenir le catalyseur entièrement hétérogène ciblé. L’immobilisation a tout d’abord été réalisée par adsorption physique, mais l'activité des ω-TAs ainsi immobilisées s’est avérée être limitée. La modification de PdAu@ZIF-8 par adsorption de Ni2+ a légèrement amélioré l'immobilisation de l'enzyme. Dans une autre approche, le ZIF-8 fonctionnalisé avec des fonctions carbonyles grâce à un échange partiel “post-synthèse” des ligands 2-méthylimidazole du ZIF-8 avec des dérivés carbonylés d’imidazole, a conduit à des résultats encourageants, avec une amélioration de l'activité de la 3HMU immobilisée sur le ZIF-8 ainsi préparé d'un facteur 4. Cette approche prometteuse sera exploitée plus avant prochainement afin de synthétiser le catalyseur entièrement hétérogène 3HMU@PdAu@ZIF-8 visé dans ce projet de doctorat.
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Dates et versions

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  • HAL Id : tel-04772445 , version 1

Citer

Yifan Zan. Development of heterogeneous chemoenzymatic catalysts based on Metal-Organic Framework for the selective and eco-friendly amination of alcohols. Catalysis. Sorbonne Université, 2023. English. ⟨NNT : 2023SORUS518⟩. ⟨tel-04772445⟩
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